艾滋病研究是公共卫生安全教育部重点实验室重大传染病研究方向之一。长期以来，团队始终以国家艾滋病防控需求为导向，围绕“降低新发感染率”和“降低病死率”为目标，不断开展创新研究，逐渐形成了艾滋病传播风险和预防干预技术策略、HIV感染与衰老及心脑血管病和恶性肿瘤等相关慢性非传染性疾病（NCDs）的关联机制与防控等研究方向。
研究团队先后主持完成了国家传染病防治科技重大专项、国家自然科学基金、国家艾滋病防治社会动员项目、全球基金项目、上海市项目、美国国立卫生研究院（NIH）项目等30余项研究课题，系统研究了男男性行为人群（MSM）、暗娼人群、吸食新型毒品人群、HIV感染者配偶、农民工等各类重点人群艾滋病感染和传播风险，建立了MSM人群个体感染HIV风险评估工具并得到大规模网络在线推广应用；通过大规模人群现场实验，研究证实了抗病毒治疗可有效减少HIV单阳夫妻间二代传播，科学评估了“MSM人群暴露前服用抗病毒药物预防HIV新发感染”策略的接受度和有效性，为国家制定相关艾滋病防控战略提供了关键决策依据；利用大数据分析，绘制了我国艾滋病患者肿瘤死亡图谱，并应用血清学和分子生物学检测技术，阐明了我国HIV感染者及高危人群中卡波西肉瘤相关病毒（KSHV）、丙型肝炎病毒（HCV）、乙型肝炎病毒（HBV）、人类乳头瘤病毒（HPV）、Epstein-Barr病毒（EBV）等恶性肿瘤病毒的感染和复制水平及其基因亚型特征；建立了国际前沿的HIV感染与衰老前瞻性研究队列（CHART队列），初步掌握了HIV感染与衰老及主要慢性病之间的关联，结合基因组、代谢组等多组学技术，开展进一步的系统流行病学研究。研究团队先后获中华医学科技奖三等奖（2020）、上海市预防医学会科技进步奖二等奖（2018）、浙江省科技进步奖三等奖（2014）、浙江省医药科技进步奖二等奖（2014）。
艾滋病研究团队高度重视和积极服务国家和社会，连续近二十年服务于国家艾滋病综合防治示范区工作，对口支持国家艾滋病防治重点地区云南省德宏傣族景颇族自治州和四川省凉山彝族自治州开展艾滋病综合防治工作。团队成员先后赴云南德宏开展调研、技术支持及现场教学40余次，共同研制了一整套技术策略并应用于国家技术手册和规范，指导当地发表百余篇中英文论文，在复旦大学公共卫生学院对州各委办局负责人、卫生行政和疾病预防控制部门负责人和业务骨干进行了3期、每期30-40人、每期一周的全面轮训；接受业务骨干专业进修14人；在德宏州成功遏制艾滋病快速蔓延势头的防控成绩中发挥了积极作用。研究团队受中华红丝带基金会委托，在四川凉山特别是妇幼人群中开展艾滋病帮扶工作，取得了显著社会效益，2015年获颁中华红丝带基金会“十年行动奖”。对MSM人群中艾滋病蔓延势头迅猛的浙江省台州市提供技术支持，培养出了一支由市、县两级CDC专业人员组成的完整的艾滋病专业防治队伍。艾滋病研究团队现有6名成员，其中教授2人、副教授2人，技术员2人。
团队负责人：
何纳，博士、教授，博士生导师，主要从事艾滋病自然史和预防干预研究。何纳教授现任复旦大学公共卫生学院院长，兼任国务院学位委员会学科评议组成员、教育部高等学校公共卫生与预防医学类专业教学指导委员会副主委、国家疾病预防控制专家咨询委员会委员、国家卫生应急体系建设指导专家、中华预防医学会公共卫生教育分会主委、中华预防医学会流行病学分会副主委、中华医学会公共卫生分会副主委、中国医师协会公共卫生医师分会副会长、中国医疗保健国际交流促进会公共卫生与预防医学分会副主委、《中华流行病学杂志》副总编辑、《中华疾病控制杂志》副主编、《上海预防医学》杂志副主编、《中国艾滋病性病》杂志编委、《BioScience Trends》公共卫生资深编委。
团队成员：
张铁军，博士，教授，博士生导师，主要从事艾滋病合并肿瘤病毒感染流行病学。张铁军博士是复旦大学公共卫生学院流行病学教授、美国内布拉斯加大学林肯分校病毒学中心博士后。一直从事于艾滋病相关病毒的流行病学研究，相关研究结果在Journal of Hepatology、Emerging infectious diseases和Clinical Microbiology and Infection等权威期刊上发表。主持国家传染病重大专项、国家重点研发计划、国家自然科学基金等课题10余项。
丁盈盈，博士，副教授，硕士生导师，主要从事艾滋病与衰老及心血管病流行病学研究。丁盈盈博士是复旦大学公共卫生学院流行病学副教授，美国加州大学洛杉矶分校流行病学博士。一直从事艾滋病相关流行病学研究工作。相关研究结果在国际期刊Lancet HIV、Clinical Microbiology and Infection、Journal of Infectious Diseases等权威期刊上发表。主持或承担国家传染病重大专项、国家自然科学基金青年基金项目和面上项目等课题。现为中国女医师协会委员、中国医疗保健国际交流促进会公共卫生与预防医学分会委员、上海预防医学会艾滋病性病学专业委员会副主委。
刘星：博士，副教授，硕士生导师，主要从事艾滋病相关恶性肿瘤流行病学。刘星博士是复旦大学公共卫生学院流行病学副教授，美国加州大学洛杉矶分校流行病学博士。主持国家自然科学基金项目，参与国家传染病防治科技重大专项课题，相关研究成果在Lancet HIV、International Journal of Cancer等权威期刊上发表。现为中华预防医学会公共卫生教育分会委员兼秘书。