肝炎研究团队是公共卫生安全教育部重点实验室重大传染病研究方向之一，长期开展乙肝病毒（HBV）、戊肝病毒（HEV）的分子流行病学和生物信息学研究，为在我国人群中进一步降低肝炎发病率直至消灭肝炎做出努力。
研究团队现有3名成员，其中教授博导1人，副教授3人，副研究员1人，技术员1人。团队先后主持国家自然科学基金面上项目和青年项目8项，上海市教委科研创新重点项目1项。基于母婴队列人群，探索母婴人群显性和隐匿性乙型肝炎病毒（OBI）感染及其传播规律，并为以后进行妊娠相关结局及其它母婴传播性疾病的研究奠定基础；系统研究乙肝疫苗全程免疫后0-18岁人群OBIs感染规律；识别OBIs病毒分子变异及其进化规律，探索其生物学功能，为新型乙型肝炎病毒感染试剂和疫苗研制奠定基础；评价OBIs对现有乙肝疫苗免疫策略的影响及其改进措施。前期结果提示，“大三阳”“小三阳”产妇母乳喂养与人工喂养的婴儿发生慢性乙肝感染的机会相当，即未有升高风险，进一步支持了世界卫生组织的观点，即在现有乙肝疫苗免疫策略下，大三阳乙肝产妇亦可安全母乳喂养；提示应加强对专业医师（产科、肝病科、儿科等）进行健康教育的重要性。该结果无论对于增进母子健康和减轻家庭经济负担，均具有重要的现实意义，前后得到多家媒体（科技日报、健康报、Global Times、上海ICS电视台、解放日报、南方日报、扬子晚报、山东电视台等）的广泛关注，并入选2011年《复旦大学年鉴》公共卫生学院部分。虽然OBI较难以得以识别，经研究后发现，现有乙肝免疫策略仍能有效阻断OBI的母婴传播。
此外，肝炎团队也长期、系统研究戊型肝炎的临床流行病学、人畜-季节-地区分布规律、时空进化和传播特征，阐明人群戊肝发病存在“春节效应”规律，即全年发病情况存在波动、在春节期间明显上升。同时，推算急性戊肝的病毒血症持续时间，为临床急性戊肝患者的隔离期提供依据，并为进一步减少人群的传播风险奠定基础。郑英杰教授提出“华东地区猪是人戊型肝炎的主要宿主”的观点，发表在美国J Infect Disease杂志，该观点受到新华社、健康报、文汇报、东方电视台、北京科技报等国内媒体的广泛关注。
团队负责人：
郑英杰，流行病学博士、教授、博士生导师，美国加州大学洛杉矶分校访问学者。主要从事因果模型与流行病学方法；组学技术与母婴健康；传染病流行病学（肝炎病毒与脑炎病毒）等研究。主持纵向科研项目20项，其中国家自然基金面上项目5项、上海市教委科研创新重点项目1项、国家重点研发/科技支撑（子）项目3项。发表论文80余篇//SCI 16篇。在国际主流学术大会（流行病学、感染性疾病、分子流行病学与进化基因组学、微生物学等）进行10余次口头报告并担任多次分会主席；国家自然基金委、科技部、教育部、卫生部、上海市各级科研项目及科技奖评审人。主编《医院感染学》，参编《临床流行病学》、电子书包《预防医学》及2021年亚太地区肝病学会指南"Asian Pacific Association for the Study of Liver (APASL) Guidelines: Hepatitis B Virus in Pregnancy"。开设“因果思维”微信阅读号（CausalEpi），首届“一健康基金”优秀教师奖获得者。兼任上海市预防医学会第三届免疫规划专委会副主任委员、上海市预防医学会第七届卫生检验专业分会委员、中华医学会核医学分会第十届委员会肿瘤学组委员；以及《中华流行病学杂志》通讯评委，《病毒学报》、《儿科胃肠病学，JPGN》中文版和《上海预防医学》编委等职。
团队成员：
陆一涵，副教授，硕士生导师，长期从事戊型肝炎与丙型肝炎的分子流行病学和生物信息学研究，主要研究方向为戊肝病毒人畜共患、丙肝病毒基因型/亚型在各人群间的分布与传播、肝炎病毒在志愿献血人群的感染水平、肝炎病毒基因的时间-空间进化变异特征及其对药物治疗的影响等。先后主持国家自然科学基金青年基金和青年-面上连续资助项目各1项、上海市卫生局局级科研项目1项，主要参与国家自然科学基金面上项目2项、上海市教委科研创新重点项目1项、上海市卫计委委级科研项目和青年科研项目1项、上海市区级卫计委项目1项。发表相关论文30余篇，其中以第一/通讯作者发表SCI论文5篇，包括1篇1区期刊论文（Veterinary Journal，SCI分区“农林科学类”1区期刊）和1篇编辑部认定的高访问量论文（BMC Infectious Diseases，Highly accessed，即14天内访问量超过1000次）；此外1篇中文论文（中华预防医学杂志）被收录进中国科学信息技术研究所评选出的2012年度“领跑者5000”中国精品科技期刊顶尖学术论文。在2016年上海市疾控中心的“世界肝炎日”专家访谈宣传活动中，受邀撰写“戊型肝炎的流行特征与防治策略”并发表于上海疾控微信公众号。目前在肯尼亚Kenyatta国家医院从事HIV/AIDS患者合并肝炎病毒感染的流行病学研究。